《石河子大學學報（自然科學版）》（雙月刊）創刊于1983年，是石河子大學主辦的綜合性學術期刊。

《石河子大學學報（自然科學版）》本刊立足本校，面向全國，注重學術性，主要刊登生物科學、農業科學、醫學、理工科、數學、物理、化學自然科學各學科基礎研究和應用研究方面的學術論文。其辦刊宗旨主要是：及時報道最新科技研究成果，為推動學術交流和實施科教興國戰略服務。讀者對象是國內外科技工作者。獲獎情況：2006、2008、2010、1012年榮獲“首屆中國高校特色科技期刊”獎；在新疆第三次優秀科技期刊評比中榮獲新疆科技期刊綜合效益獎；在第四、五、六、七次獲綜合效益獎及二等獎；2007年6月被中國科學信息研究所評定為“中國科技核心期刊”；并被收入中國科技論文與引文數據庫（CSTPCD）。