《北京中醫藥大學學報》（月刊）創刊于1959年，本報系中央級的高級中醫藥學術刊物，由北京中醫藥大學主辦。

《北京中醫藥大學學報》現分別屬于中國自然科學核心期刊、中國中文核心期刊、全國中醫藥優秀期刊、全國優秀科技期刊、中國科學引文數據庫首批入選的315種期刊之一、北京高校自然科學學報系統及全國高等醫藥學院校學報系統優秀學報等。主要反映中醫藥研究的新成果、新成就、新動態，貫徹“雙百方針”，活躍學術空氣，促進中醫藥學術發展。

《北京中醫藥大學學報》被北大1992版核心期刊、北大1996版核心期刊、北大2000版核心期刊、北大2004版核心期刊、北大2008版核心期刊收錄。是1989年獲全國高等醫藥學院校學報編輯質量優秀學報一等獎；1990年獲北京高等學校自然科學學報優秀編輯質量一等獎；1995年獲北京市高校系統自然科學學報優秀學報一等獎、全國中醫藥科技期刊一等獎（99）、全國高校學報優秀科技期刊（A類）二等獎（04）。