《上海大學學報（自然科學版）》（雙月刊）是綜合性自然科學學術期刊，1995年創辦，由原《上海科技大學學報》（1978~1994年）和原《上海工業大學學報》（1979~1994年）合并而成。本刊為雙月刊。

《上海大學學報（自然科學版）》本刊主要刊登本校師生（包括海內外校友）在基礎科學和應用科學領域的最新研究成果，適量刊登校外作者的優秀科技論文（國家自然科學基金課題和863高科技計劃等項目產出的科技論文）。內容主要包括：通信與信息工程、機電與自動化、冶金與材料、建筑科學、生命科學、數理化科學和管理科學等方面。讀者對象為高校師生、研究人員和工程技術人員。獲獎情況：1996年獲得第二屆上海市優秀科技期刊二等獎；1999年獲得上海市高等學校優秀自然科學學報二等獎；1999年獲得全國優秀高校自然科學學報及教育部優秀科技期刊三等獎；2000年獲得《CAJ-CD規范》執行優秀獎；2004年獲得全國高校優秀科技期刊二等獎；2004年和2006年獲上海市科技期刊編校質量優秀獎。